本部

• 管理委员会
• 重点学科
• 临床科室
• 医技科室
• 研究所、中心
• 职能科室

管理委员会

• 医疗管理委员会
• 护理管理委员会
• 耳鼻喉科管理委员会
• 急诊管理委员会
• 骨科管理委员会
• 消化内科管理委员会

重点学科

• 重点学科
• 重点发展学科
• 重点特色学科

重点学科

• 呼吸中心（呼吸与危重症医学科）
• 呼吸中心（胸外科）
• 心脏中心
• 泌尿外科
• 急诊医学中心
• 妇产科

重点发展学科

• 肝胆外科
• 耳鼻咽喉头颈外科
• 血液科
• 感染与临床微生物科
• 肿瘤科
• 骨科
• 麻醉医学科
• 医院药学
• 检验科
• 放射介入影像中心
• SICU（重症医学）

重点特色学科

• 职业病与中毒医学科
• 生殖医学中心
• 护理学
• 疝和腹壁外科

临床科室

• 内科
• 外科
• 妇儿
• 五官科
• 全科医学科
• 其他科室

内科

• 呼吸与危重症医学科
• 心内科
• 内分泌科
• 肾内科
• 神经内科
• 肿瘤科
• 血液科
• 风湿免疫科
• 消化内科
• 高压氧科
• 感染和临床微生物科
• 职业病与中毒医学科
• 放射治疗科

外科

• 普外科
• 泌尿外科
• 骨科
• 神经外科
• 肝胆外科
• 麻醉科
• 疼痛科
• 胸外科
• 血管外科
• 重症医学科
• 整形外科
• 心外科
• 乳腺外科
• 甲状腺颈部外科
• 介入医学科
• 疝和腹壁外科
• 肛肠外科
• 运动与康复医学科
• 急腹症外科

妇儿

• 妇产科
• 儿科
• 生殖中心

五官科

• 眼科
• 口腔科
• 耳鼻咽喉头颈外科

全科医学科

• 全科医学科

其他科室

• 急诊医学中心
• 中医科
• 皮肤性病与医学美容科
• 临床心理科
• 理疗科
• 体检中心

医技科室

• 放射科
• 超声医学科
• 检验科
• 核医学科
• 病理科
• 输血科
• 药事部
• 营养科

超声医学科

• 心脏超声
• 综合超声

研究所、中心

• 北京市呼吸疾病研究所
• 高压氧治疗中心
• 临床检验中心
• 职业病与中毒医学中心
• 医学研究中心
• 高血压病研究北京市重点实验室
• 远程医学中心
• 心肺脑复苏北京市重点实验室
• 北京市呼吸与危重症诊治工程技术研究中心
• 临床流行病学研究室